Как использование материнского капитала и вопрос исковой давности влияют на оформление долей в квартире и защиту в суде

В браке купили квартиру в ипотеку. Для полного погашения ипотеки по договору займа заняли деньги в строительной организации, что возводила дом. Заем частично погасили материнским капиталом. Этим занималась жена, и как она это сделал - не знаю. Полностью расплатились за квартиру 7 лет назад, оформив по 1/2 доли в этой квартиры на меня и жену. Для получения материнского капитала у нотариуса писали обязательство о предоставлении доли детям в квартире. В какой конкретно - не указали, т.к. была еще квартира, где и хотели выделить доли. Естественно ни какого письменного соглашения об этом с женой не составляли. После вторую квартиру жена официально переписала на родственника, и отказалась в ней выделить доли детям. В 2016 г. брак расторгли, квартира так и осталась по 1/2 доли на меня и жену, а сейчас она подала иск о лишении себя и меня по 1/4 доли в квартире и оформлении этих долей на детей. Можно ли было материнский капитал использовать для погашения договора займа? Не пропущен ли срок исковой давности по исковым требованиям? Как в суде разрешаются дела в таких случаях, и как защититься, а то она и первую квартиру забрала, и в этой хочет лишить меня 1/4 доли? Подал иск в суд по определению проживания младшего ребенка со мной - решения еще нет, и повлияет ли это на решение суда о перераспределении долей. Что делать, суд потом может и не решить в мою пользу проживание ребенка со мной, если доля уменьшится?