Как расчитываются отпускные за неиспользованный отпуск из 2013 года при уходе в отпуск в 2016 году?

Отпуск Вам начисляется за отработаенное время. Отпуск должен предоставляться за календарный год. Работодатель обязан предоставить работнику отпуск, по договоренности с ним, может выплатить компенсацию. Отпуск Вы не получили в 2013 году, за время в 2013 году. Фактически неполучение Вами отпуска и компенсации в то время является нарушением. Так как в отпуск Вы не пошли, Вам обязаны были выплатить компенсацию уже тогда. Однако несмотря на нарушение, срок привлечение к административной ответственности у работодателя уже вышел. Поэтому сейчас работодатель перед Вами ровным счетом ничем не рискует и может Вас вообще в отпуск не пускать.

В любом случае, это отпуск который должен был произойти в 2013 году, у отпуска есть денежный эквивалент, который исчисляется из размера заработной платы за год. В 2013 году Ваш отпуск стоил одну сумму, сейчас другую. Поэтому да, работодатель действует правомерно, оплачивая Вам за 2013 года.

Вы, конечно, можете обратиться в суд, руководствуясь положениями трудового кодекса, что, дескать, размер оплаты отпуска исчисляется из размера заработной платы за год, который предшествовал отпуску. Но, повторюсь, Вы идете в отпуск на в 2016 году, а в 2013 году, и суд не встанет на Вашу сторону, начисляя Вам плату за отпуск 2013 года, по размеру зарплаты 2016.