Начальник ворует деньги, доказательства есть. Куда обращаться?

Добрый день Кристина, в вашем случае все зависит от ситуации в которой вы находитесь в данный момент, так если действительно "ВОРОВСТВО", то это уголовное дело! И вы должны понимать об ответственности директора (возможен реальный срок), так трудовые отношения регулируются ТК РФ, если же хотите ответственности то вам в полицию, прокуратуру.

При возникновении трудностей по составлению исков, и заявления обращайтесь.