На каком расстоянии от дороги можно построить НТО (автомагазин)?

Зависит от обстоятельств. Но без согласия дорожников - только за пределами придорожной зоны.

Согласно ст. 90 ЗК РФ землями транспорта признаются земли, которые используются или предназначены для обеспечения, в том числе, деятельности организаций и (или) эксплуатации объектов автомобильного иных видов транспорта и права на которые возникли у участников земельных отношений по основаниям, предусмотренным настоящим Кодексом, федеральными законами и законами субъектов Российской Федерации (п. 1).

Земельные участки в границах полос отвода автомобильных дорог могут предоставляться в установленном настоящим Кодексом порядке гражданам и юридическим лицам для размещения объектов дорожного сервиса. Для создания необходимых условий использования автомобильных дорог и их сохранности, обеспечения соблюдения требований безопасности дорожного движения и обеспечения безопасности граждан создаются придорожные полосы автомобильных дорог. Установление границ полос отвода автомобильных дорог и границ придорожных полос автомобильных дорог, использование таких полос отвода и придорожных полос осуществляются в соответствии с законодательством Российской Федерации об автомобильных дорогах и о дорожной деятельности (п. 3).

Отсюда: sudact.ru