Верховный суд отменил решение городского суда - Как отказаться от этого судьи и просить перевести дело к другому по территориальности?

Если суд кассационной инстанции не указал в судебном акте на необходимость при новом рассмотрении передать дело иному составу судей, то вряд ли.

Если заявлять отвод по этому основанию, он скорее всего будет отклонен.

Я считаю, что вы зря беспокоитесь. Для судей решение кассационного суда практически библия, они следуют его выводам неукоснительно.