К сожалению лично ни как не могу приехать в Москву и подать документы по месту регистрации брака на развод.

В этом нет необходимости. Ваш брак уже расторгнут.

В России признание иностранных решений о расторжении брака означает, что за иностранным решением признается такая же юридическая сила, как и за решением российских судов (или органов записи актов гражданского состояния) о расторжении брака. Наличие иностранного решения о расторжении брака дает основания считать супругов разведенными. При этом, не требуется государственная регистрация расторжения брака, произведенного иностранным судом, в порядке, установленном для государственной регистрации актов гражданского состояния (если только брак между вами не регистрировался в РФ). Лицо, брак которого расторгнут решением иностранного суда, может, ссылаясь на это решение, подлежащее признанию, вступить в России в новый брак.

Брак считается прекратившимся со дня вступления иностранного решения в законную силу. Вместе с тем признание иностранного судебного решения о расторжении брака не требует какой-либо специальной процедуры, если только против признания не возражает второй супруг или иное заинтересованное лицо. Так, загс, куда лицом, вступающим в брак, предъявлено в подтверждение того, что он не состоит в браке, решение иностранного суда о расторжении его прежнего брака, рассматривает это решение как подтверждение прекращения брака, удостоверившись в том, что решение вступило в законную силу. С уважением,

Извините, не увидела часть вопроса, где говорилось о том, что брак в Москве зарегистрирован.

Тогда вам надо взять решение суда Японии, апостилировать его, перевести на русский и оформить в консульстве доверенность на получение свидетельства о расторжении брака. Если потребуется помощь - обращайтесь. С уважением,