Из двушки я переехала в однушку с сыном, а она взяла деньгами.

Поскольку Ваша доля была приобретена в период брака через сделку по купле-продаже (т.е. возмездной сделке), то она является совместно нажитой, а следовательно при разводе и разделе имущества будет делиться между Вами и бывшим мужем в равных долях.

если вы сможете доказать источник денег на покупку квартиры и найти 2-3 свидетелей, то он не сможет претендовать на вашу квартиру

Начнем с того, что муж может претендовать только на Вашу одну треть. Право на половину от нее, то есть на 1\6 Вашей однокомнатной квартиры ему может принадлежать только при условии, что исходная двухкомнатная квартира или часть ее была Вашей совместной собственностью, приобретенной в браке. В любом случае претендовать на долю сына он не может, т.к. имущество детей не подлежит разделу между супругами.

Думаю, что вам надо разобраться полюбовно, заключить согласие о разделе совместно нажитого имущества при разводе, либо заключить брачный договор, пока вы еще в браке ( конечно я все это советую скорее всего напрасно, но если все же есть хоть один шанс - воспользуйтесь им). А если нет. То тогда при разводе вам надо будет урегулировать все эти вопросы в суде - тогда не пожалейте денег, наимите юриста, хотя бы для того, что бы он вам правильно составил процессуальные документы, дело это выиграть можно, но проблематично.

Удачи.

В худшем случае - это компенсация мужу за его долю, но уверяю вас шансы есть на выигрыш

Да, может, Вам в суде надо доказывать происхождение денег. Дело это очень и очень сложное.