Сколько по времени нельзя продавать квартиру, купленную за военный сертификат?

Продать квартиру можно в любое время, просто доход с продажи облагается налогом.

В соответствии с ст. 217.1 НК РФ минимальный предельный срок владения квартирой в Вашем случае должен составлять 5 лет, чтобы не облагалось налогом.