Скажите, могу ли я не возвращать деньги от работодателя за прохождения медкомиссии при поступлении на работу?

Можете не возвращать. Это ваше желание и право. Если сумма критична возвращайте если нет, то не возвращайте. Работодатель сам включит эту сумму в первую выплату, причитающуюся работнику: аванс или зарплату

Вы от лица работодателя обращаетесь или от работника?

Согласно положениям статей 212 и 213 ТК РФ, работодатель обязан компенсировать сотруднику затраты на проведение медосмотра в полном объёме. Эта практика применяется в случаях, когда соискатель прошёл медицинскую комиссию самостоятельно или получил направление на профосмотр через отдел кадров.

Закон не регулирует способы возмещения расходов, поэтому компенсация за медосмотр при приёме на работу обычно производится следующим образом:-По факту. Сотрудник проходит комиссию самостоятельно, после чего предоставляет в бухгалтерию предприятия заявление, заверенное работодателем на возмещение указанной суммы;-Предварительное соглашение. Работодатель отправляет соискателя на прохождение медкомиссии, составив акт о последующем возмещении расходов;-Договорённость. Здесь между компанией и медучреждением заключается договор, на основании которого направленные сотрудники проходят врачей бесплатно. Этот вариант предпочтителен для соискателей и работодателей. Первые не несут финансовых затрат при трудоустройстве, вторые получают скидку согласно правилам предоставления мед услуг. .

По договору платных услуг на основании справок и счетов граждане по своему желанию и праву каждый год возвращают 13% по декларации 3-НДФЛ. Никто никого не ограничивает в этом праве.

Просто чтобы лишних вопросов не возникало рекомендую написать заявление на возврат суммы уплаченной вами самостоятельно на имя работодателя в бухгалтерию организации.