Можно ли взыскать сумму с бывшей супруги через суд и вернуть начисление пенсии на свой счет в связи с пропажей денег, предназначенных для лечения ребенка?

Для начала необходимо обратится с целью проверки в орган опеки и попечительства. Взыскать деньги с супруги всё же представляется маловероятным. Поскольку Вы истратили добровольно д/с на лечение своего ребенка, которого Вы и так обязаны содержать. А вот с супруге грозит ответственность за ненадлежащее выполнение родительских обязанностей. Вплоть до лишения родительских прав.

СК РФ Статья 69. Лишение родительских прав

Родители (один из них) могут быть лишены родительских прав, если они:

уклоняются от выполнения обязанностей родителей, в том числе при злостном уклонении от уплаты алиментов;

отказываются без уважительных причин взять своего ребенка из родильного дома (отделения) либо из иной медицинской организации, образовательной организации, организации социального обслуживания или из аналогичных организаций;

(в ред. Федеральных законов от 24.04.2008 N 49-ФЗ, от 25.11.2013 N 317-ФЗ, от 28.11.2015 N 358-ФЗ, от 28.03.2017 N 39-ФЗ)

(см. текст в предыдущей редакции)

злоупотребляют своими родительскими правами;

жестоко обращаются с детьми, в том числе осуществляют физическое или психическое насилие над ними, покушаются на их половую неприкосновенность;

являются больными хроническим алкоголизмом или наркоманией;

совершили умышленное преступление против жизни или здоровья своих детей, другого родителя детей, супруга, в том числе не являющегося родителем детей, либо против жизни или здоровья иного члена семьи.