Мы с коллегами работали над муницыпальным контрактом, скоро должна пройти оплата за нашу работу

Если вы работаете по Трудовому договору, то системы оплаты труда, размер и порядок её выплаты, должны быть установлены в ТД и внутренних документах работодателя. В этой связи непонятно на каком основании Вы хотите получать деньги по контракту? Деньги не ваши, а организации и их расходование компетенция руководства, а не ваша. Если у вас нет письменных договоренностей с руководителем и заработная плата на предприятии установлена в соответствии ТК РФ, то и требовать вам нечего, кроме положенной по ТК РФ заработной платы, премий, надбавок.

Ответ дан исключительно на информации вопроса.