Можно ли получить альтернативную службу после окончания отсрочки от армии?

Можете рассчитывать на альтернативную службу.

Федеральный закон от 25.07.2002 г. № 113-ФЗ

Об альтернативной гражданской службе

Статья 3. Граждане, направляемые на альтернативную гражданскую службу

1. На альтернативную гражданскую службу направляются граждане мужского пола в возрасте от 18 до 27 лет, которые не пребывают в запасе, имеют право на замену военной службы по призыву альтернативной гражданской службой, лично подали заявление в военный комиссариат о желании заменить военную службу по призыву альтернативной гражданской службой и в отношении которых в соответствии с настоящим Федеральным законом призывной комиссией, создание которой регулируется Федеральным законом от 28 марта 1998 года № 53-ФЗ "О воинской обязанности и военной службе" (далее - Федеральный закон "О воинской обязанности и военной службе"), принято соответствующее решение. (В редакции федеральных законов от 22.08.2004 № 122-ФЗ; от 31.12.2005 № 211-ФЗ)

2. На альтернативную гражданскую службу не направляются граждане, которые в соответствии с Федеральным законом "О воинской обязанности и военной службе":

имеют основания для освобождения от призыва на военную службу;

не подлежат призыву на военную службу;

имеют основания для предоставления отсрочки от призыва на военную службу.

Если у вас есть вышеуказанные основания, то вы имеете право.

Военкомат нарушает инструкцию по уведомлению призывника, на альтернативную службу рассчитывать можешь Федеральный закон от 25.07.2002 г. № 113-ФЗ

Об альтернативной гражданской службе ст 3