Продажа товаров через интернет-магазин с ККМ в другом городе - законно ли это?

У Вас должен быть с партнером агентский договор, по которому он будет действовать от Вашего имени.

Законна, все у Вас нормально.

А в чем проблема? На чеке будет стоять Москва. Да и территориально месторасположение аппарата не проблема.

Партнером в данном случае - я так понял, называли человека, которы просто будет осуществлять определенную работу, а потом получать зарплату.

Если организация состоит на налоговом учете в одном регионе и имеет обособленные подразделения (торговые точки) в других регионах, то все используемые ККМ этой организации согласно действующему законодательству о ККМ должны быть зарегистрированы в налоговом органе по адресу, указанному в учредительных документах организации, т.е. по месту учета.

Это утверждение не верно!!! Да и ККМ уж нет в помине... Хотя может в Магнитогорске и иные правила или свою Правительство РФ.. Не знаю. Всяко бывает.

Так как регистрация ККТ, используемой обособленным подразделением, по месту нахождения организации является прямым нарушением п. 15 Постановления Правительства РФN 470 "Об утверждении Положения о регистрации и применении контрольно-кассовой техники, используемой организациями и индивидуальными предпринимателями", в соответствии с которым заявление о регистрации ККТ, подлежащей применению обособленным подразделением пользователя, представляется им в налоговый орган по месту нахождения подразделения. При этом, обособленное подразделением понимается в НК РФ отлично от ГК РФ.

Но у вас ИП и нет обособленных подразделений. Посему все законно.