Могут ли в МУП КХ работать близкие родственники: например заведующая складом и мастер, главных бухгалтер и инженер по ТБ.

да, а почему нет, только если локальными актами это не запрещено и не нарушает этику МУП

Могут,таких ограничений ТК РФ не содержит.

Это ограничением не является

ТК РФ не сохранил (ст. 20 КЗОТ РСФСР), и данное ограничение, но оно существует в ряде нормативных правовых актов, предназначенных для регулирования государственной гражданской службы, труда сотрудников правоохранительных органов, работников органов местного самоуправления, где не допускается совместная работа близких родственников при условии подчиненности или подконтрольности одного из них другому.

Таким образом можете работать

ст 13 Федерального закона «О муниципальной службе в Российской Федерации»

 1. Гражданин не может быть принят на муниципальную службу, а муниципальный служащий не может находиться на муниципальной службе в случае:

5) близкого родства или свойства (родители, супруги, дети, братья, сестры, а также братья, сестры, родители, дети супругов и супруги детей) с главой муниципального образования, который возглавляет местную администрацию, если замещение должности муниципальной службы связано с непосредственной подчиненностью или подконтрольностью этому должностному лицу, или с муниципальным служащим, если замещение должности муниципальной службы связано с непосредственной подчиненностью или подконтрольностью одного из них другому;

Работники МУПов не являются муниципальными служащими. Указанные взаимосвязи работников нарушением не являются. Но для проверки законности и обоснованности действия МУПа Вы можете подать жалобу в прокуратуру.