Или наше дело насильно удерживается и никуда не передается, пока на завершится камералка?

Передача дел это внутриведомственная процедура самих налоговых инспекций и это обстоятельство не должно создавать для налогоплательщика дополнительных обязанностей. Отчитываться организация должна в налоговую инспекцию по новому месту нахождения с момента регистрации изменений (даты постановки на учет в новом налоговом органе). Вы не должны вникать в процедуру передачи дел и пытаться что-то оспорить в этом. Процедура передачи дел определена для налоговых органов, а не для налогоплательщиков (Приказ ФНС от 20 декабря 2004 г. № САЭ-3-09/165@).

Т.е. разбирайтесь по существу нарушения ваших прав, а именно: если решение по камеральной проверке неблагоприятно для организации и нарушает ее права, то обжалуйте решение в установленном порядке. Согласно указанному Приказу (п.2.4.) налоговый орган по прежнему месту нахождения проводит сверку расчетов налогоплательщика с бюджетом, государственными внебюджетными фондами на дату снятия налогоплательщика с учета в связи с изменением места нахождения в соответствии с установленным порядком. Поэтому по результатам сверки и может возникнуть решение по камеральной проверке. Кроме того налоговики вполне могут вынести решение задним числом, до снятия с учета. Налоговики этим не гнушаются. Из личного опыта споров с налоговиками, в том числе судебных, имею много фактов подлога документов со стороны налоговиков.

С уважением,