Должны ли мы оплатить налог с продажи комнаты и с продажи однокомнатной квартиры если да в каком размере или я могу вернуть налог?

Вы неправильно поняли то, что прочитали в НК РФ. Разъясняю. Статьёй 220 НК РФ предусмотрено два имущественных налоговых вычета: 1) в связи с продажей имущества (означает освобождение от уплаты налога); 2) в связи с приобретением жилья (означает возврат уплаченного налога).

1. Вычет в связи с продажей имущества предоставляется на всю вырученную сумму, если имущество находилось в собственности 3 года и более. В этом случае налог не платится. Если имущество находилось в собственности менее 3 лет, то вычет предоставляется в размере 1 млн. руб. при продаже жилья и в размере 125000 при продаже иного имущества. Этим вычетом можно пользоваться каждый раз при продаже имущества.

2. Вычет в связи с приобретением жилья предоставляется путём возврата уплаченного налога, исчисленного с суммы, израсходованной на приобретение жилья, но не превышающей 1 млн. руб. Этот вычет предоставляется только один раз.

Теперь конкретно по Вашей ситуации. Если Вы комнату продавали как долю в квартире, то сумма от продажи комнаты полностью покрывается суммой вычета и налог платить не нужно. Если продавали строго как комнату, то на тот период (2006 год) комната считалась иным имуществом и сумма вычета в этом случае будет 125000 рублей, т.к. в собственности находилась менее 3 лет (с суммы превышения платится налог). При продаже квартиры Вы также можете воспользоваться вычетом, поскольку квартира в собственности находилась менее 3 лет, то сумма вычета не более 1 млн. руб., а с суммы превышения нужно будет уплатить налог.

С уважением,