Так как же теперь быть, нужно ли сдавать эту печать и если да, то куда и в каком порядке?

По-моему, прямо этот вопрос не урегулирован.

На аналогичный вопрос о печатях (штампах, бланках) ликвидируемых кредитных организаций (банков) Центральный банк РФ в 1999 г. разъснил, что порядок уничтожения печатей и т.п. должен регулироваться внутренними документами банка. При ликвидации банка составляется акт об уничтожении печатей, подписываемом членами ликвидационной комиссии, представителями кредиторов.

В данном случае ликвидации юридического лица не произошло. Прежде чем принимать решение об уничтожении, обратитесь в отдел милиции по месту нахождения с запросом о сдаче печати преобразованного ЗАО. По крайней мере, ряд ранее действовавших документов предусматривали необходимость этого. Если получите отказ, целесообразно принять решение об уничтожении печати, штампов коллегиальным органом ООО, образовать комиссию. Комиссия уничтожает печати и составляет акт об уничтожении.Если имеется журнал учета выданных работникам (структурным подразделениям) печатей (штампов) отметку об уничтожении необходимо отразить в журнале учета.

Использование печати несуществующей организации противоречит закону. В зависимости от целей использования печати (получение кредита, заключение хозяйственных договоров, получение материальных ценностей и т.п.) можно говорить о мошенничестве, незаконной предпринимательской деятельности, то есть ответственность может наступать вплоть до уголовной.