Организация на заплатила за оказанные услуги. Как можно взыскать?

Пишите претензию, далее обращайтесь в суд.

Статья 309 ГК РФ Общие положения

Обязательства должны исполняться надлежащим образом в соответствии с условиями обязательства и требованиями закона, иных правовых актов, а при отсутствии таких условий и требований - в соответствии с обычаями делового оборота или иными обычно предъявляемыми требованиями.