Проблема залогодателей - как погасить нужный кредит, если банк списывает деньги на другой?

Если такой пункт есть в договоре, то изменить его Вы не сможете. Банк прав в данном случае, условия договора обязательны (ст.309, 319, 421 ГК РФ)

Для начала надо добиться того, чтобы банк предоставил отдельный счет на имя лица, вносящего платежи для погашения кредита. Если будете вносить деньги на счет должника, то банк будет руководствоваться договорами (ст. 309 ГК РФ) и спишет так как ему удобно.

"Как направить денежные средства в счет погашения нужного кредита."

Нужно в платежном поручении указать номер кредитного договора и период, за который вносится платёж.

Тогда никто платёж не переведёт по иному назначению.

И эта платёжка будет доказательством в суде неправоты банка согласно ст. 71 ГПК РФ (Письменными доказательствами являются содержащие сведения об обстоятельствах, имеющих значение для рассмотрения и разрешения дела, акты, договоры, справки, деловая корреспонденция, иные документы и материалы, выполненные в форме цифровой, графической записи, в том числе полученные посредством факсимильной, электронной или другой связи либо иным позволяющим установить достоверность документа способом), если банк нарушает законы.

Данный спор с банком можно решить в судебном порядке, подав иск о признании обязательств по кредитному договору исполненными и прекращении залога (ст. 313 ГК РФ).