в Мск обычно нотариально заверенную копию подают (если по почте). а вообще воспользуйтесь сервисом на сайте налог.ру по регистрации в качестве ип. там можно заполнить заявление и отправить в налоговую.

Вам лучше обратиться к профессионалам. Рекомендую им http://reg-nalog.ru/