Почему статья 306 не была снята при обращении в ИЦ МВД?

Здравствуйте. Забыли, видимо. Обращайтесь в суд с требованием о внесении изменений о статусе судимости.

Это сбой системы, обе ваши судимости погашены

Никакого сбоя системы нет.

Проблема в подпункте 74.3 Административного регламента Министерства внутренних дел Российской Федерации по предоставлению государственной услуги по выдаче справок о наличии (отсутствии) судимости и (или) факта уголовного преследования либо о прекращении уголовного преследования, утвержденный приказом Министерства внутренних дел Российской Федерации от 7 ноября 2011 г. N 1121 (далее – Административный регламент МВД) действует в редакции Приказа МВД России от 19.02.2015 N 263 «О внесении изменений в нормативные правовые акты МВД России».

В соответствии с абзацем 1 подпункта 74.3 Административного регламента МВД в справке о наличии (отсутствии) судимости: «В графе "имеются (не имеются) сведения о судимости (в том числе имевшейся ранее) на территории Российской Федерации" при наличии сведений об имеющейся и имевшейся ранее судимости указываются: дата осуждения, наименование суда, вынесшего приговор, пункт, часть, статья уголовного закона, по которым лицо было осуждено, срок и вид наказания, дата и основание освобождения, основания снятия судимости».