Как защитить права ребенка на алименты при разных системах начисления в Германии и России?

Вам скорее всего удобнее решать данный вопрос в РФ.

Если доход лица, обязанного уплачивать алименты является непостоянным или же слишком низким, вы можете воспользоваться нормами ст. 83 СК РФ и требовать алименты в твердой денежной сумме.

Признание и исполнение решений иностранных судов и арбитражей на территории Российской Федерации

В соответствии с действующими нормами российского права единство судебной системы Российской Федерации обеспечивается, в том числе путем признания обязательности исполнения на всей территории Российской Федерации судебных постановлений, вступивших в законную силу.

Обязательность на территории Российской Федерации постановлений судов иностранных государств, международных судов и арбитражей определяется международными договорами Российской Федерации, то есть иностранное судебное решение подлежит исполнению в случае наличия международного правового акта, предусматривающего такую возможность.

При этом процедура исполнения может быть осложнена предшествующим ей требованием о необходимости признания судебного решения. Процесс приведения в исполнение в стране судебного решения, вынесенного в другой стране, ознаменован экзекватурой (от лат. exsequare - выполнить).

т.е. скорее всего получив решение немецкого суда вы вновь попадете на российский суд.

Имеет смысл просто провести это все уже в рф и предоставить счет для оплаты.