Оспорена сумма ущерба в гражданском процессе после амнистии - законность и возможность обжалования решения

Бывшему директору ООО предъявлено Обвинение прокурором. В основе - проверка, проведенная следствием, доказавшая вину и рассчитавшая сумму ущерба на основании проведенной в рамках проверки экспертизой. Обвиняемый в суде написал заявление об амнистии. Получил амнистию. Вынесено Постановление. В нем написано, что сумму ущерба мы можем получить в гражданском процессе. Весь расчет суммы в Постановлении прописан с точностью. В гражданском процессе нам отказали в иске о получении суммы ущерба, т.к. мы не представили свой расчет суммы, а сослались на расчет. Проведенный следствием и полностью прописанный в Постановлении об амнистии. Насколько это законно? От уголовной ответственности освобожден по амнистии, теперь и сумму ущерба не нужно выплачивать. Это была только первая инстанция-районный суд. Понимаю: оспаривать, но ведь в апелляцию новые документы не приложишь и насколько законным был бы наш личный расчет? Следствие основывалось на экспертизу, на изъятые в обществе бух. документы, выписки банка и учитывая все это провело расчет. Чем он не законен и не принят судом? Каждая цифра рассчитана и прописана в Постановлении об амнистии. А судья сказала, что нам нужно читать ст.61 ГПК РФ. на мой взгляд, эта статья подтверждает нашу правоту.