Вопрос о договоре аренды или безвозмездном пользовании нежилым помещением, принадлежащим родственнику, для моего стоматологического ООО

Добрый вечер, Тарас! Конечно же, правильнее будет заключить договор аренды, а не безвозмездного пользования. Причину Вы абсолютно точно назвали сами. Конечно, это ещё надо будет доказать представителям налоговой, но, как говорится, не надо привлекать лишнее внимание. А что касается физ. лица или ИП, так здесь вся разница будет только в том, что при ситуации с ИП (при условии, что ИП находится на упрощённой системе налогообложения со ставкой 6% от полученного дохода) Вашей тёще придётся платить вышеупомянутый налог 6% от суммы арендной платы,а не 13%, если она будет выступать как физ. лицо в качестве арендодателя. А вот здесь есть два момента, которые уже Вам необходимо рассмотреть и тогда уже решить вопрос в пользу ИП или физ. лица. Во-первых, никто не неволит Вас определить достаточную небольшую ставку арендной платы, чтобы эти 13% (в случае для физ.лица) были необременительны. А во-вторых, при последующей продаже когда-нибудь этого помещения с Вашей тёщи "попросят" 13% от суммы, которая будет указана в договоре купли-продажи. И никакие 3 года в собственности, вычет на 1 миллион рублей и так далее в этом случае не помогут. Причина проста: продажа имущества, которое участвовало в предпринимательской деятельности ИП. Здесь налоговая действует достаточно чётко, как показывает практика последних 7 лет. Поэтому резюме: если нет разногласий с тёщей, на прибыль она не претендует (как Вы и написали), то рекомендация заключить договор аренды с ней как с физ. лицом, при этом определив весьма небольшую ставку арендной платы.

Удачи Вам!