Можно ли получить субсидию на покупку долевой квартиры, если единственным владельцем является один из дольщиков, а оба дольщика продают квартиру?

Можете воспользоваться для покупки квартиры у участников общей долевой собственности. Количество собственников, которые продают квартиру для использования субсидии значения не имеет. Продавцы должны договориться как будут распределены средства субсидии между ними. Или можете использовать субсидию на покупку доли одного из них.