Как поступить, если начальник ГАИ отказывает о прекращении уголовного дела даже при согласии потерпевшего и подозреваемого на примирение

В суде нужно об этом просить.

"Уголовно-процессуальный кодекс Российской Федерации" от 18.12.2001 N 174-ФЗ (ред. от 06.07.2016) (с изм. и доп., вступ. В силу с 01.09.2016)

УПК РФ, Статья 25. Прекращение уголовного дела в связи с примирением сторон

(в ред. Федерального закона от 05.06.2007 N 87-ФЗ)

(см. текст в предыдущей редакции)

Суд, а также следователь с согласия руководителя следственного органа или дознаватель с согласия прокурора вправе на основании заявления потерпевшего или его законного представителя прекратить уголовное дело в отношении лица, подозреваемого или обвиняемого в совершении преступления небольшой или средней тяжести, в случаях, предусмотренных статьей 76 Уголовного кодекса Российской Федерации, если это лицо примирилось с потерпевшим и загладило причиненный ему вред.

начальник ГАИ отказывает о прекращении уголовного дела

Это как? Какое право вообще имеет решать вопрос по возбужденному уголовному делу начальник ГАИ? Это абсурд. Расследование по делу ведет следователь и никто больше!

Обращайтесь к следователю для прекращения дела а ни к какому-то начальнику ГАИ, он не имеет права прекращать уголовное дело.

Что делать если, начальник ГАИ отказывает о прекращении уголовного дела (ДТП с тяжкими телесными) до суда, в то время когда потерпевший и подозреваемый согласны на примирение и решили этот вопрос финансово?

Ничего Вы не сделаете, это право, а не обязанность следствия/дознания.

Если потерпевшему причинен тяжкий вред здоровью в результате ДТП, то начальник ГИБДД не вправе прекращать дело, административное дело направляется в отдел полиции по месту совершения или в УВД города. Вам лучше обратиться к помощи адвоката очно.