Что делать, если мой магазин подлежит к сносу? К кому идти, с кем договариваться?

Попробуйте признать право на постройку в судебном порядке (конечно, если речь о капитальном объекте, а не о нестационарном торговом объекте).

В соответствии с п.2 ст.222 ГК РФ "Право собственности на самовольную постройку может быть признано судом, за лицом, в собственности, пожизненном наследуемом владении, постоянном (бессрочном) пользовании которого находится земельный участок, на котором создана постройка, при одновременном соблюдении следующих условий:

1) если в отношении земельного участка лицо, осуществившее постройку, имеет права, допускающие строительство на нем данного объекта;

2) если на день обращения в суд постройка соответствует параметрам, установленным документацией по планировке территории, правилами землепользования и застройки или обязательными требованиями к параметрам постройки, содержащимися в иных документах;

3) если сохранение постройки не нарушает права и охраняемые законом интересы других лиц и не создает угрозу жизни и здоровью граждан."

Можно даже попробовать признать решение о сносе незаконным (особенно, если речь о нестационарном объекте).

Ответ на Ваш вопрос сильно зависит от вида строения (капитальное\некапитальное) и Ваших прав на землю под ним, а также оснований, по которым Вам земля предоставлена.