Как передаются деньги с обвиняемого на суде в счет применения.

Если вы имели ввиду в счет примирения, то можно передать распиской в которой указать номер дела или искового заявления, дату составления, процессуальный статус сторон, сумму передаваемых денежных средств, и указать что в качестве возмещения материального и морального ущерба. ЛУчше это делать после принятия процессуального документа где все оговорено.

Факт передачи денег подтверждается либо распиской (распространенный вариант), либо соглашением (у меня в практике), где расписываются все обстоятельства, имеющие значение для дела. Если идет речь о примирении, то обязательным условием передачи денег - ходатайство от потерпевшего о прекращении уголовного дела. По идее, это все должен знать Ваш адвокат.