Куда обращаться региональному госслужащему г. Москва для получения субсидии на приобретение жилья?

Достаточно странный вопрос. Если имеется соответствующее региональное положение о таких субсидиях - вряд ли в нем прописан иной порядок, чем в федеральном.

6. Принятие гражданского служащего на учет для получения единовременной выплаты осуществляется на основании заявления гражданского служащего, представляемого на имя руководителя в комиссию федерального государственного органа по рассмотрению вопросов предоставления гражданским служащим единовременных выплат по месту прохождения гражданской службы (далее - комиссия), в котором указывается, что по прежним местам гражданской службы единовременная выплата не предоставлялась. К указанному заявлению прилагаются следующие документы: