Где прописано, что главный бухгалтер подчиняется напрямую руководителю организации?

Конечно негоже некоторым юристам в своих ответах ссылаться на нормы Федерального закона от 21 ноября 1996 г. № 129-ФЗ «О бухгалтерском учете» утратившего силу с 1 января 2013 года

В настоящее время действует Федеральный закон "О бухгалтерском учете" от 06.12.2011 N 402-ФЗ (последняя редакция)

В части 3 статьи 7 сказано: . Руководитель экономического субъекта обязан возложить ведение бухгалтерского учета на главного бухгалтера

Сами подумайте каким образом руководитель может возложить ведение бухгалтерского учета, если главный бухгалтер ему не подчиняется Из части 3 ст 7 данного федерального закона следует прямое подчинение главного бухгалтера руководителю

Подчиненность главного бухгалтера руководителю определяется также локальными нормативными актами организации ст 8 ТК РФ,условиями трудового договора ст 57 ТК РФ и должностной инструкцией

Федеральный закон от 06.12.2011 N 402-ФЗ (ред. от 23.05.2016) "О бухгалтерском учете"

""Статья 7. Организация ведения бухгалтерского учета

""1. Ведение бухгалтерского учета и хранение документов бухгалтерского учета организуются руководителем экономического субъекта.

""2. В случае, если индивидуальный предприниматель, лицо, занимающееся частной практикой, ведут бухгалтерский учет в соответствии с настоящим Федеральным законом, они сами организуют ведение бухгалтерского учета и хранение документов бухгалтерского учета, а также несут иные обязанности, установленные настоящим Федеральным законом для руководителя экономического субъекта.

""3. Руководитель экономического субъекта обязан возложить ведение бухгалтерского учета на главного бухгалтера или иное должностное лицо этого субъекта либо заключить договор об оказании услуг по ведению бухгалтерского учета, если иное не предусмотрено настоящей частью. Руководитель кредитной организации обязан возложить ведение бухгалтерского учета на главного бухгалтера. Руководитель экономического субъекта, который в соответствии с настоящим Федеральным законом вправе применять упрощенные способы ведения бухгалтерского учета, включая упрощенную бухгалтерскую (финансовую) отчетность, а также руководитель субъекта среднего предпринимательства, за исключением экономических субъектов, указанных в части 5 статьи 6 настоящего Федерального закона, может принять ведение бухгалтерского учета на себя.

(в ред. Федеральных законов от 28.12.2013 N 425-ФЗ, от 04.11.2014 N 344-ФЗ)

(см. текст в предыдущей "редакции")