Перенос пени по квартплате в задолжность - правомерно ли действие управляющей компании?

У меня была задолжность по кварплате и пени за несвоевременную оплату. Я заплатила задолжность, а пени не заплатила! Хотела заплатить отдельной квитанцией. В итоге, не уплаченные мною пени, управляющая компания переносит в задолжность по кварплате! На сколько я понимаю это совсем не правельно! На что управляющая дает мне объяснение, что у них так в компьютерной программе заложенно! Программа сама расчитывает, какая сумма из оплаты идет на погашение основного долга, какая на погашение пени! Это правомерно?