Могу ли я сейчас как то попытаться решить эту ситуацию или уже поздно?

Добрый день, Елена! Отказ Департамента законен и обжаловать его смысла нет, только потеряете время. Сейчас Вы можете прописать ребенка, на это согласия Департамента не требуется.

Елена, увы, но Вам отказали законно, обжаловать это в суде я думаю, нет смысла, но это ваше дело и решать Вам.

Отказ незаконен. Да и за согласием обращение не требовалось - Правила регистрации и инструкция позволяют регистрировать супруга по месту жительства и без учета нормы жилой площади. А изменение договора социального найма - действие следующее за вселением и регистрацией, а не предшествующее ей.

(для коллег: "Требования жилищного законодательства о соблюдении учетной нормы жилого помещения не распространяются на право нанимателя на вселение в занимаемое им жилое помещение своего супруга, детей и родителей" Определение Судебной коллегии по гражданским делам Верховного Суда РФ от 18 ноября 2008 г. N 5-В08-117). Рекомендую подать в ОФМС заявление о регистрации по месту жительства и, в случае отказа, обжаловать его в суд.

Елена, если у Вас родился ребенок, то его можно прописать в упомянутую Вами комнату без проблем. Далее, рекомендую приватизировать комнату, и уже на собственность, при согласии всех собственников комнаты, Вы сможете прописаться без проблем.