Возможно ли получить жилищный сертификат, если дом не зарегистрирован и отсутствует собственник?

Тогда возникает вопрос, на каком основании Вы состоите на учете? Получается, что рассматриваемый дом не является помехой для получения жилья по сертификату, так или нет? Может просто из него выписаться и снять жилье? Не будет это воспринято как ухудшение жилищных условий (ст. 53 ЖК РФ)?

153 статья ЖК РФ в случае отчуждения жилья будет применена, но Вам это зачем. Хотя если 5 лет Вы еще будете служить, можно попробовать, но рискованно. Жилье нужно получать пока служите.

Обратите внимание на Приложение № 6 к Правилам выпуска и реализации государственных жилищных сертификатов в рамках реализации основного мероприятия «Выполнение государственных обязательств по обеспечению жильем категорий граждан, установленных федеральным законодательством» государственной программы Российской Федерации «Обеспечение доступным и комфортным жильем и коммунальными услугами граждан Российской Федерации», в котором предусмотрена форма Обязательства о расторжении договора социального найма жилого помещения (найма специализированного жилого помещения) и об освобождении занимаемого жилого помещения (о безвозмездном отчуждении находящегося в собственности жилого помещения (жилых помещений) в государственную (муниципальную) собственность).

Из этого обязательства видно, что жилье участник программы обязуется сдать в 2-месячный срок с даты приобретения им жилого помещения посредством реализации государственного жилищного сертификата. Получается, что Вам нужно найти орган, которому Вы сдадите жилье (будь то глава органа местного самоуправления (командир подразделения, начальник подразделения (службы) федерального органа исполнительной власти, федерального государственного органа, глава администрации населенного пункта).

Опять может возникнуть вопрос о собственнике, социальном найме и т.п.