Боюсь сообщить начальнику о своем втором декрете - можно ли меня уволить после написания заявления?

Сказать Вам в любом случае придётся. Если сами не скажите, доброжелатели донесут. Вообще компания ещё при приеме настаивает на написании заявления на увольнение, явно не чиста на руку. Но сейчас не об этом. Уволить могут, Вы же оправдали их худшие опасения. Так что готовьтесь к тому что придётся отстаивать свои права. И скорее всего через суд. Причём изначально подайте жалобу в прокуратуру. Но вообще процедура увольнения это ведь не только заявление, но и приказ в котооом вам нужно расписаться. Также вполне ожидаема «травля» со стороны руководства. Вы во избежание этого может уйти на больничный, причём чуть ли не до декрета.