Сосед грозится подать в суд из-за поднятой стены гаража - что делать?

Он имеет право обратиться в суд, если считает, что его права каким то образом нарушены. Только в суде ему нужно будет доказать в чем именно нарушение прав. - ст. 55, 56 ГПК РФ.Например, строительную экспертизу предоставить, которая покажет, что может протечь стена. Будет ли он это делать? Это не дешево. Если экспертиза будет не в его пользу, то суд ему откажет.

Поэтому, если у Вас все сделано правильно, и протечки не будет, то переживать Вам не стоит. Хотя, конечно нужно было получить письменное согласие у соседа.

Но демонтировать ничего не нужно самостоятельно. Ждите суда. Будете доказывать, что права соседа не нарушаются.