Почему МФЦ требуют присутствие отца при регистрации ребенка 12 лет, при условии развода и отсутствия совместного проживания?

Ирина, к сожалению для Вас, действия МФЦ правомерны.

В соответствии с п.3 ст.65 СК РФ место жительства детей при раздельном проживании родителей устанавливается соглашением сторон.

При отсутствии соглашения спор между родителями разрешается судом исходя из интересов детей и с учетом мнения детей. При этом суд учитывает привязанность ребенка к каждому из родителей, братьям и сестрам, возраст ребенка, нравственные и иные личные качества родителей, отношения, существующие между каждым из родителей и ребенком, возможность создания ребенку условий для воспитания и развития (род деятельности, режим работы родителей, материальное и семейное положение родителей и другое).

Т.о., отец должен давать согласие на регистрацию ребёнка по Вашему адресу регистрации.

Всего доброго.