Отказ вписать РСФСР в паспорт места рождения - значимый юридический факт и нарушение закона?

Вообще, МФЦ в паспорт ничего не вписывает. Сотрудник МФЦ передает документы в миграционную службу для осуществления государственной услуги "замена паспорта". Если место рождения по свидетельству о рождении РСФСР, то в новом паспорт е также указывается РСФСР. Данный вопрос регулируется Приказом МВД России от 16.11.2020 N 773:

183.3.3. В реквизите "Место рождения" записи производятся в именительном падеже и с использованием разрешенных сокращений в соответствии с записями, произведенными в свидетельстве о рождении или паспорте, подлежащем замене.

Наименования внутригородского района в реквизит "Место рождения" не вносится.

В реквизите "Место рождения" в отношении граждан, родившихся на территории Российской Федерации, указываются следующие сведения:

город федерального значения - наименование города, наименование государства (Российская Федерация либо Россия, либо РСФСР);

другой город - наименование города и субъекта Российской Федерации, наименование государства (Российская Федерация либо Россия, либо РСФСР);

остальные населенные пункты - наименование населенного пункта, района, субъекта Российской Федерации, наименование государства (Российская Федерация либо Россия, либо РСФСР).

В отношении граждан, родившихся на территории бывшего СССР (до 6 февраля 1992 г.), указываются следующие записи, произведенные в свидетельстве о рождении:

в республиканских, краевых и областных центрах - наименование города и республики (края, области);

в других городах - наименование города в области (края, республики), в состав которой они входят и наименование самой области (края, республики);

в остальных населенных пунктах - наименование населенного пункта, района, области (края, республики).