Живу в Казахстане я и ребенок граждане Казахстана, отец в РФ (,гражданин РФ), куда подать на алименты? В мировой или местный суд.

Мировой и местный - в России это один суд, потому что мировой не может быть не местным, т. к. его судебные участки находятся в городском поселении гражданина, обращающегося в мировой суд.

Не знакома с законодательством Казахстана, но подавать на алименты Вы должны по месту своего жительства. Основания следующие.

Установление и взыскание алиментов гражданам государств - участников СНГ осуществляются в порядке, предусмотренном национальным законодательством страны, на территории которой они проживают. Государства - участники СНГ признают и обеспечивают исполнение судебных решений по алиментным делам на основании п. 3 ст. 62 Конституции РФ и ст. ст. 5, 6 Соглашения стран СНГ от 09.09.1994 "О гарантиях прав граждан в области выплаты социальных пособий, компенсационных выплат семьям с детьми и алиментов".

Исполнительные документы, выданные по установленной форме в целях исполнения решений по алиментам на территории одного государства (или их заверенные копии), принимаются на территории другого государства без легализации (ст. 9 Соглашения стран СНГ от 09.09.1994).

Таким образом, алименты с работника - гражданина РФ бухгалтерия будет удерживать в общем порядке на основании исполнительного листа, выданного в Казахстане.