Налоговая требует оплаты НДС за ввоз товара в Москве - верно или нет?

Все правильно.

СОГЛАШЕНИЕ

от 25 января 2008 года

О ПРИНЦИПАХ ВЗИМАНИЯ КОСВЕННЫХ НАЛОГОВ

ПРИ ЭКСПОРТЕ И ИМПОРТЕ ТОВАРОВ, ВЫПОЛНЕНИИ РАБОТ,

ОКАЗАНИИ УСЛУГ В ТАМОЖЕННОМ СОЮЗЕ

Правительство Республики Беларусь, Правительство Республики Казахстан и Правительство Российской Федерации, именуемые в дальнейшем Сторонами,

признавая общепринятые нормы и правила международной торговли,

согласились о нижеследующем:

Статья 3

Принцип взимания косвенных налогов при импорте товаров

При импорте товаров на территорию одного государства - участника таможенного союза с территории другого государства - участника таможенного союза косвенные налоги взимаются налоговыми органами государства-импортера, если иное не установлено законодательством этого государства в части товаров, подлежащих маркировке акцизными марками (учетно-контрольными марками, знаками). Косвенные налоги не взимаются при импорте на территорию государства - участника таможенного союза товаров, которые в соответствии с законодательством этого государства не подлежат налогообложению при ввозе на его территорию.

Это принцип действовал давно и в соглашении (отменного) с Белоруссией до Таможенного союза.

НДС уплачивается в стране импортере. Однако могут варианты. Не совсем понятно, почему вы уплачивали НДС по контракту, т.к. 1. при экспорте товаров с территории одного государства - члена таможенного союза на территорию другого государства - члена таможенного союза налогоплательщиком (плательщиком) (далее - налогоплательщик) государства - члена таможенного союза, с территории которого вывезены товары, применяются нулевая ставка налога на добавленную стоимость (далее - НДС) при представлении в налоговый орган документов, предусмотренных пунктом 2 настоящей статьи.

Ситуацию надо разбирать подробнее.