Как правильно оформить совместную собственность на ипотечную квартиру в гражданском браке?

После погашения ипотеки жена может подарить вам долю в квартире. Либо взыскивайте с неё переведённые деньги на основании ст 1102 ГК РФ.

Ничего не сделаете, пока квартира в залоге у банка.

Вы пишите что у нотариуса во время брака составили документ что Вы ни каким образом не имеете отношение к ипотеке...

Я могу только догадываться, но если вы заключили брачный договор, то в него можно внести изменения и определить что каждому принадлежит такая то доля в квартире.

Вообще конечно нужно видеть документы, из вашего вопроса мало что понятно.

Ваши переводы это дар, благотворительность, которые не возвращаются и не предоставляют вам права собственности на квартиру, так как вы не в браке и между вами отсутствуют договорные обязательства

Можно составить договор займа на определенную сумму, которая будет перечисляеться ежемесячными платежами до полного погашения кредита, с обязательством возврата займа после полного погашения кредита, например в течении месяца, с залогом 1/2 доли квартиры или всей квартиры в вашу пользу, если договор о предшествующей ипотеке не содержит запрета на последующую ипотеку (ст. 43 ФЗ Об ипотеке)

Затем можно в качестве отступного выделить вам долю в праве собственности