Выдадут ли мне права если я не ходил в армию и инспектор с меня требует справку с военкомата уже второй раз.

Вам нужна справка о прохождении водительской медицинской комиссии с отметкой, что допускаетесь к управлению ТС.

Требование сотрудника ГИБДД справку из военкомата незаконно. Для получения в/у необходимо иметь паспорт гражданина РФ (с регистрацией по месту сдачи на права), мед. справка, документы о прохождении обучения в автошколе, квитанцию на оплату госпошлины за получение в/у.