Проблемы с регистрацией гражданского мужа в нашем доме - как отменить их и что делать?

Если он фактически там не проживает вы можете признать его не приобретший право пользования, или просто выписать по суду, так как собственники против. Для выбора каким путём пойти нужно смотреть документы и вникать в вашу ситуацию. Обратитесь к юристу.

В суд обращайтесь с иском о выселении на основании вот этой статьи.

Статья 304. Защита прав собственника от нарушений, не связанных с лишением владения

[Гражданский кодекс РФ] [Глава 20] [Статья 304]

Собственник может требовать устранения всяких нарушений его права, хотя бы эти нарушения и не были соединены с лишением владения.

А чего искать какие-то ещё нормы закона, когда есть ст. 31 ч. 4 ЖК РФ?! Жилые помещения - это не только квартиры, но и дома в деревне. Вселяли его, как члена семьи (фактического супруга) одного из собственников. Он при вселении подпадал под категорию "иные граждане" (ч. 1 ст. 31), признававшиеся членами семьи собственника.

Статья 31 ч. 1, 4 ЖК РФ:

1. К членам семьи собственника жилого помещения относятся проживающие совместно с данным собственником в принадлежащем ему жилом помещении его супруг, а также дети и родители данного собственника. Другие родственники, нетрудоспособные иждивенцы и в исключительных случаях иные граждане могут быть признаны членами семьи собственника, если они вселены собственником в качестве членов своей семьи.

4. В случае прекращения семейных отношений с собственником жилого помещения право пользования данным жилым помещением за бывшим членом семьи собственника этого жилого помещения не сохраняется, если иное не установлено соглашением между собственником и бывшим членом его семьи. Если у бывшего члена семьи собственника жилого помещения отсутствуют основания приобретения или осуществления права пользования иным жилым помещением, а также если имущественное положение бывшего члена семьи собственника жилого помещения и другие заслуживающие внимания обстоятельства не позволяют ему обеспечить себя иным жилым помещением, право пользования жилым помещением, принадлежащим указанному собственнику, может быть сохранено за бывшим членом его семьи на определенный срок на основании решения суда. При этом суд вправе обязать собственника жилого помещения обеспечить иным жилым помещением бывшего супруга и других членов его семьи, в пользу которых собственник исполняет алиментные обязательства, по их требованию.

5. По истечении срока пользования жилым помещением, установленного решением суда, принятым с учетом положений части 4 настоящей статьи, соответствующее право пользования жилым помещением бывшего члена семьи собственника прекращается, если иное не установлено соглашением между собственником и данным бывшим членом его семьи. До истечения указанного срока право пользования жилым помещением бывшего члена семьи собственника прекращается одновременно с прекращением права собственности на данное жилое помещение этого собственника или, если отпали обстоятельства, послужившие основанием для сохранения такого права, на основании решения суда.

Вы и Ваша сестра заключали с этим гражданином какой-нибудь гражданско-правовой договор (найма или безвозмездного пользования домом), который явился основанием для его регистрации на площадь? Если да, то нужно сам договор изучать для грамотного построения судебной позиции.