Какая должна быть сумма предъявляемого иска, правильно ли я понимаю, что только 50% которые мы им оплатили по Договору?

Помогите разрешить следующий вопрос. Наша организация, является обособленным подразделением ФГУП. Мы заключили договор подряда на выполнение работ. В условиях договора, указанно, что наша организация оплачивает 50% авансом, оставшиеся 50% суммы после сдачи работ и подписанного акта приемки-передачи. 50% мы оплатили, работа выполнена не была. Мы собираемся, подать на Подрядчика в суд, вот здесь и возникает ряд вопросов: 1.Наш Директор наделен своими полномочиями, на основании Доверенности. В свою очередь Доверенность нам выдал, московский филиал, а филиалу «головная организация», получается на филиал, передоверил. Не возникнут ли у нас в Арбитраже проблем с такой доверенностью, т.к. в Арбитражном Кодексе, сказано, что только на основании Доверенности, про передоверие я ничего не нашла. 2.Подготавливая в Суд Исковое заявление, как правильно оно будет называться «О взыскании задолженности» и/или «О возврате денежной суммы». 3.Какая должна быть сумма предъявляемого иска, правильно ли я понимаю, что только 50% которые мы им оплатили по Договору? 4.В Договоре прописана Договорная неустойка, предъявляя иск, я рассчитываю эти проценты от суммы всего договора и/или от 50%, которые мы оплатили? 5.Могу ли я также предъявить вместе с Договорной неустойкой, рассчитать им неустойку по ст. 395 ГК РФ, это практикуется? 6.И последний вопрос, мы в данную организацию направляем письма, с требованием выполнить работы, в противном случае, грозимся, подать в суд, однако письма возвращаются, каковы должны быть мои действия: Может нужно сделать запрос в налоговою, у меня предположение, что данной организации больше нет. Если ее нет, то в суд подавать нет смысла, куда тогда нужно обращаться? Помогите разрешить сложившуюся ситуацию, у меня маленький опыт, а Директор настаивает срочно подавать заявление в Арбитраж.