Как лучше просить суд вернуть нам эти пени: так и писать, как сказано в ст. 79 НК (до дня фактического возврата)

Не совсем так. Дело в том, что обязанность ИФНС начислить проценты на возвращаемую сумму излишне взысканного налога и пени, установлена законом (п.4 ст.79 НК РФ). Другими словами, ИФНС должна выполнить требование закона и без судебного решения (Определение КС № 503-О). В этой же статье указан и срок для начисления процентов. Поэтому, в вашем случае еще нет оснований для исчисления конкретной суммы процентов. Для этого требуется, наступление определенных фактов:

1.чтобы суд признал действия налоговиков неправомерными, т.е. требуется решение в вашу пользу, только после этого возникает ваше право на проценты;

2. и факт того, что налоговики возвратили взысканные суммы без начисления процентов.

У вас пока нет таких доказательств. Исчислять конкретную сумму процентов следует только в том случае, если вы предъявляете самостоятельный иск о взыскании процентов. Это обычно происходит тогда, когда налоговики выплачивают взысканные суммы налога, но "забывают" начислить проценты на эту сумму, как того требует п.4 ст. 79 НК РФ. Следовательно в вашем случае, вы заявляете требование об обязании ИФНС возвратить на счет организации конкретную сумму излишне взысканных налога, пени. А ИФНС обязана в течение месяца исполнить решение суда и возвратить взысканные суммы с начисленными процентами (п.5 ст.79).

С уважением,