Возможно ли исполнение обязательств по оплате товара по договору поставки товарным зачетом на сумму задолженности.

Не очень понятно, что вы имеете в виду, говоря о товарном зачете, но если это встречная поставка иных товаров, то сколько угодно. Изменение условий договора, в том числе и в порядке расчетов, есть право сторон, и никто не может его отменить, если стороны договорились.