Мною был подан иск к налоговой инспекции, которая отказалась предоставить мне имущественный налоговый вычет с суммы 1 млн.

Уважаемый Александр! Ваш вопрос в определённой мере спорен, поскольку скорее всего суд будет применять аналогию с уплатой госпошлины при рассмотрении таких споров а Арбитражном суде.Согласно норме пп. 5 п. 1 ст. 333.22 НК РФ при подаче заявлений о возврате (возмещении) из бюджета денежных средств государственная пошлина уплачивается исходя из оспариваемой денежной суммы в размерах, установленных пп. 1 п. 1 ст. 333.21 Кодекса.

До появления этой нормы в законодательстве имелась неопределенность по данному вопросу. С одной стороны, заявление о возврате удачно маскировалось под заявление об обжаловании бездействия налогового органа, выразившегося в несовершении действий по возврату (возмещению) сумм налога, или же под заявление о признании незаконным решения налогового органа об отказе в возврате (возмещении) сумм налога. В случае удовлетворения требований заявителя решение суда, как правило, включало в себя указание на признание действий (бездействия), решения незаконными и на обязание государственного органа вернуть конкретную денежную сумму. Поэтому позиция тех, кто склонялся к определению размера госпошлины по делам о возврате (возмещении) сумм налогов исходя из ставок госпошлины, установленных для имущественных исков, имеющих оценку, тоже была обоснованна.В настоящее время однозначный ответ на этот вопрос дан в пп. 5 п. 1 ст. 333.22 НК РФ. Раз Вы просите вернуть уплаченный подоходный налог или освободить на определённый период от уплаты налога, то это требование имущественное и госпошлину в суд общей юрисдикции нужно платить от суммы иска по пп.1 ч.1 ст.333.19 НК РФ. Таким образом суд вправе считать, что госпошлину Вы исчислили неправильно.