Может ли жена претендовать на мою квартиру (она в ней прописана) и если да, то что положено ей?

Может, в порядке п. 4 статьи 31 ЖИЛИЩНОГО КОДЕКСА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Статья 31. Права и обязанности граждан, проживающих совместно с собственником в принадлежащем ему жилом помещении

4. В случае прекращения семейных отношений с собственником жилого помещения право пользования данным жилым помещением за бывшим членом семьи собственника этого жилого помещения не сохраняется, если иное не установлено соглашением между собственником и бывшим членом его семьи. Если у бывшего члена семьи собственника жилого помещения отсутствуют основания приобретения или осуществления права пользования иным жилым помещением, а также если имущественное положение бывшего члена семьи собственника жилого помещения и другие заслуживающие внимания обстоятельства не позволяют ему обеспечить себя иным жилым помещением, право пользования жилым помещением, принадлежащим указанному собственнику, может быть сохранено за бывшим членом его семьи на определенный срок на основании решения суда. При этом суд вправе обязать собственника жилого помещения обеспечить иным жилым помещением бывшего супруга и других членов его семьи, в пользу которых собственник исполняет алиментные обязательства, по их требованию.

Вы можете ее выселить только в судебном порядке после расторжения брака. Суд может дать ей срок на проживание. К разхделу имущества ее выселение не имеет отношения.

По ее квратире, ей принадлежала по 1/2 с бабушкой изначально в первой квратире, не ясно, когда была продана она и куплена другая, вы вкладывали деньги или нет. Если были вложения, вторая квратира была куплена ужде в браке, то вы имели право на долю в той крвтаире, соответственно на долю от продажи вы также имеете право. Но жена если сможет доказать, что не было доплат, она купила ровно за те деньги, то вы не будете иметь прав на деньги