Я покупаю квартиру в строящемся доме.

Это не налог с продажи, а налог на доходы физического лица (НДФЛ). И НДФЛ не платится с прибыли, налог на прибыль существует только для юридических лиц. Законодатель просто указывает, что (какие поступления) входит в налогооблагаемую базу по налогу, какие доходы не включаются в такую базу, и какие предоставляются налоговые вычеты. Поэтому и указанная сумма, полученная от продажи имущества, будет включена в налогооблагаемую базу по НДФЛ. Но, соответственно, предоставляется и налоговый вычет, по выбору налогоплательщика, либо в размере до 1 млн.руб, либо в виде разницы между стоимостью продажи и стоимостью приобретения.

НК РФ.

"Статья 220. Имущественные налоговые вычеты

1. При определении размера налоговой базы в соответствии с пунктом 2 статьи 210 настоящего Кодекса налогоплательщик имеет право на получение следующих имущественных налоговых вычетов:

1) в суммах, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее трех лет, но не превышающих в целом 1 000 000 рублей, а также в суммах, полученных в налоговом периоде от продажи иного имущества, находившегося в собственности налогоплательщика менее трех лет, но не превышающих 125 000 рублей. При продаже жилых домов, квартир, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков и земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика три года и более, а также при продаже иного имущества, находившегося в собственности налогоплательщика три года и более, имущественный налоговый вычет предоставляется в сумме, полученной налогоплательщиком при продаже указанного имущества.

Вместо использования права на получение имущественного налогового вычета, предусмотренного настоящим подпунктом, налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с получением этих доходов, за исключением реализации налогоплательщиком принадлежащих ему ценных бумаг".