По своей сути алименты были удержаны и с имущественного налогового вычета.

Уважаемый Александр! Вы заблуждаетесь. Вы не получаете возврат НДФЛ, а получили уведомление для работодателя и не платите текущий НДФЛ, пока не используете сумму вычета. Если с Вас взысканы алименты в % от доходов, то бухгалтери со всего дохода их и удерживает, поэтому поступает абсолютно правильно.Удержание алиментов на содержание несовершеннолетних детей производится со всех видов заработной платы (денежного вознаграждения, содержания) и дополнительного вознаграждения как по основному месту работы, так и за работу по совместительству, которые получают родители в денежной (национальной или иностранной валюте) и натуральной формах в соответствии с

Перечнем видов заработной платы и иного дохода, из которых производится удержание алиментов на несовершеннолетних детей, утв. Постановлением Правительства РФ от 18.07.1996 № 841.

Доходы, из которых не удерживаются алименты:

1) премии единовременного характера (кроме премий по итогам работы за год);

2) материальная помощь, оказываемая гражданам в связи со стихийным бедствием, пожаром, хищением имущества, увечьем, а также с рождением ребенка, регистрацией брака, смертью лица, обязанного уплачивать алименты, или его близких родственников;

3) выплачиваемые при увольнении выходные пособия;

4) лечебно-профилактическое питание, выдаваемое в соответствии с законодательством о труде.

В соответствии с п. 4 названного Перечня взыскание алиментов с сумм заработной платы и иного дохода, причитающихся лицу, уплачивающему алименты, производится после удержания (уплаты) из этой заработной платы и иного дохода налогов в соответствии с налоговым законодательством. На сегодняшний день алименты взыскиваются с доходов плательщика только после того, как удержан налог на доходы физических лиц, а Вы этот налог временно не платите, поэтому со всей суммы платите алименты.