Как правильно учитывать проценты по кредитам при расчете налогооблагаемой прибыли?

Кредиты, вернее проценты по таким кредитам, и считаются отдельно. Вопрос же в том, что размер процентов, и соответственно, сумма уплаченных процентов по каждому кредиту, может быть принята в качестве расходов, при избранном Вами варианте учета, только либо по 1, либо по 2 варианту.

Вариант можете применить любой, та же ст. 269 это допускает (цитата:"При отсутствии долговых обязательств перед российскими организациями, выданных в том же квартале на сопоставимых условиях, а также по выбору налогоплательщика предельная величина процентов, признаваемых расходом (включая проценты и суммовые разницы по обязательствам, выраженным в условных денежных единицах по установленному соглашением сторон курсу условных денежных единиц), принимается равной ставке рефинансирования Центрального банка Российской Федерации, увеличенной в 1,1 раза, - при оформлении долгового обязательства в рублях и равной 15 процентам - по долговым обязательствам в иностранной валюте".)

Просто следует учитывать, что если размер процентов по кредиту, если Вы выберете указанный вариант с 1,1 ставки рефинансирования ЦБ РФ, превысит этот предел, то уплаченнные свыше 1,1 ставки рефинансирования суммы процентов уже нельзя будет относить к расходам, уменьшающим налогооблагаемую базу по налогу на прибыль.